Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms