Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl2O89104 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl2O89104 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl2O89104 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms