Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccl20O89093 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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