Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrrc6O88978 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrrc6O88978 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc6O88978 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc6O88978 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc6O88978 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc6O88978 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc6O88978 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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