Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CntfrO88507 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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