Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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