Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms