Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pknox1O70477 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pknox1O70477 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pknox1O70477 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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