Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms