Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdmt1O55055 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms