Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copb2O55029 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms