Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbieO54910 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms