Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms