Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrxO54751 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrxO54751 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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CrxO54751 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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