Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FxnO35943 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FxnO35943 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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