Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cops5O35864 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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