Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1aO35526 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1aO35526 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms