Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edil3O35474 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Edil3O35474 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms