Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TnxbO35452 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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