Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xbp1O35426 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xbp1O35426 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xbp1O35426 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xbp1O35426 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms