Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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