Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif3cO35066 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms