Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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