Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcshO08795 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcshO08795 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms