Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3aO08665 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms