Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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