Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms