Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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