Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3739L7N296 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3739L7N296 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms