Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms