Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc191J3QQ27 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms