Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms