Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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