Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms