Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20830J3KML6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20830J3KML6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20830J3KML6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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