Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms