Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms