Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms