Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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