Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm28038F7BCN9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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