Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm8247F6VRJ8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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