Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Atf6F6VAN0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atf6F6VAN0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms