Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms