Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms