Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Urb2E9Q7L1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms