Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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