Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc71lE9Q4T4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc71lE9Q4T4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccdc71lE9Q4T4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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