Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms