Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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