Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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